Zikula verwendet ab Version 1.4.0 Bootstrap zur Ausgestaltung der Oberfläche. Natürlich kann man Bootstrap aber auch bereits für 1.3.x einsetzen. Wir haben mittlerweile eine gute Hand voll Themes mit Bootstrap unter 1.3.x erstellt oder umgebaut. Problematisch kann es werden, wenn man JavaScript-Komponenten von Bootstrap einsetzen möchte, gleichzeitig aber noch Prototype von irgendeinem Modul geladen wird.
Die JavaScript-Bestandteile von Bootstrap verwenden als Basis jQuery. Dies ist bereits in Zikula 1.3.x enthalten und kann einfach - auch zusammen mit Prototype - geladen und verwendet werden.